QuantStudio 1(QS1)基础型实时荧光定量PCR仪配置方案-

2023-04-02

主要功能用途

QuantStudio 1实时荧光定量PCR仪采用新型OptiFlex光学检测架构,提供FAM、VIC 和 ROX三种常用激发和发射滤光片,实现3重实时定量分析,性价比高。运行高达100μL 样品,运行时间低至40分钟,可在单重反应中可检测低至1.5倍模板初始数量差异。

应用范围包括:

1、基因表达分析

动植物和微生物在生理病理、环境及外来胁迫下相关基因表达的变化分析以及SiRNA诱导基因沉默和基因敲除后特定基因表达水平的检测。

2、miRNA表达水平的检测

基于miRNA与特定靶基因mRNA表达水平变化间的关联,研究miRNA 调控基因表达机制。

3、基因分型(SNP genotyping,Genotyping)

利用TaqMan探针、饱和DNA染料HRM曲线分析进行基因分型,得出等位基因频率、基因型占总基因型比率等。可应用于如遗传病诊断,SNP基因分型,药物代谢酶DME基因分型,法医遗传学鉴定等。

4、拷贝数变异(CNV)

拷贝数变异(Copy number variation, CNV)是指因基因组发生重排而导致长度1KB以上的基因片段的缺失(减少)、插入、重复(增加)、重排、倒 位、DNA 拷贝数目变化,也称为拷贝数多态性(copy number polymorphisms, CNPs)。是造成物种个体差异和人类许多疾病(如癌症、遗传性疾病、心血管疾病)的一种重要遗传基础。荧光实时定量PCR检测初始样品的某个DNA 片段的拷贝数进行定量,用已知拷贝数为2的DNA内参校正而实现对目DNA 片段拷贝数的确认。

5、高分辨率溶解曲线分析(High resolution melt, HRM)

DNA序列长度、GC 含量及碱基互补性差异影响DNA双链结构的热稳定性。高分辨熔解曲线(high-resolution melt,HRM) 分析是通过实时监测升温过程中与双链DNA特异性结合的荧光染料释放的绿色荧光强度的变化,了解PCR 产物中DNA分子的解链温度情况,分析样品特定基因片段DNA组成变化。实时荧光定量PCR实验运行程序中引入溶解曲线分析环节后,可借助于专用HRM分析模块完成HRM分析。HRM用于突变扫描和基因分型,不受突变碱基位点和种类限制,既可对未知突变进行筛查、扫描,又能对已知突变进行分析,还可用于STR分析。

6、病原体检测(Pathogen detection)

实时荧光定量PCR仪能可靠用于临床医学人体上呼吸道的感染、肺炎、消化道感染、中枢神经系统等疾病,以及畜牧业、农作物病虫害的病原体的检测确认、感染严重程度的量化评估。

7、蛋白热漂移分析(Protein thermal shift)

利用实时定量PCR仪来分析热稳定性,进行配体-蛋白结合的高通量筛选,突变或修饰对蛋白热稳定性的影响

使用蛋白结合染料(如Protein Thermal Shift 染料),实时定量PCR系统上运行实时熔解实验,根据因蛋白熔解导致荧光图像差异,分析配体与蛋白的结合稳定性。可用于以高通量筛选配体与蛋白的结合, 筛选能与蛋白靶点结合的小分子和片段文库候选药物、抗体,鉴定最佳缓冲液条件以改善蛋白的纯化和分离等。

8、食品安全和GMO(genetically modified organism)检测

实时荧光定量PCR技术用于食品的微生物污染监测、肉食类食品食材来源和组成的检验、如转基因动植物基因的检测等。

9、耐药基因检测等

性能特点

QuantStudio 1 实时荧光定量PCR仪既可通过简单直观的大尺寸彩色触摸屏交互式操作,也可以进行常规PC联机操作和数据处理。

1、先进的OptiFlex光学系统

OptiFlex技术具有高亮度白光半导体光源和检测系统,确保孔与孔间测试数据精确;

具有更灵敏数据采集性能,可检测单重分析反应中1.5倍的拷贝数差异,获得10log线性动态范围;

具有多重实时荧光定量PCR分析(Multiplex real-time PCR)功能,最多可支持靶标数可达3个。

2、qPCR 数据分析软件

分析软件具有桌面版和基于Web浏览器版,能够支持云端服务器平台,能实时在线通过云平台进行远程控制实验;

可选 Applied Biosystems 云端qPCR 数据分析软件模块,实现强大的分析功能;

将实验数据实现云端安全存储,便于在线分享测试结果。

3、新型技术服务支持

由经过专业培训的现场服务工程师现场安装;

SmartStart Orientation 实践培训套餐;

使用智能远程支持工具更快地排除故障和解决问题。

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