主要功能用途
Applied Biosystems QuantStudio 7 Pro、QuantStudio 7 Flex实时荧光定量PCR仪借助于PCR反应体系中加入的荧光基团,可实时监测PCR全过程累积的荧光信号,通过荧光信号的分析对比分析,实现准确可靠地定性、相对定量和绝对定量分析。
主要应用功能包括:
1、基因表达分析
动植物和微生物在生理病理、环境及外来胁迫下相关基因表达的变化分析以及SiRNA诱导基因沉默和基因敲除后特定基因表达水平的检测。
2、miRNA表达水平的检测
基于miRNA与特定靶基因mRNA表达水平变化间的关联,研究miRNA 调控基因表达机制。
3、基因分型(SNP genotyping,Genotyping)
利用TaqMan探针、饱和DNA染料HRM曲线分析进行基因分型,得出等位基因频率、基因型占总基因型比率等。可应用于如遗传病诊断,SNP基因分型,药物代谢酶DME基因分型,法医遗传学鉴定等。
4、拷贝数变异(CNV)
拷贝数变异(Copy number variation, CNV)是指因基因组发生重排而导致长度1KB以上的基因片段的缺失(减少)、插入、重复(增加)、重排、倒 位、DNA 拷贝数目变化,也称为拷贝数多态性(copy number polymorphisms, CNPs)。是造成物种个体差异和人类许多疾病(如癌症、遗传性疾病、心血管疾病)的一种重要遗传基础。荧光实时定量PCR检测初始样品的某个DNA 片段的拷贝数进行定量,用已知拷贝数为2的DNA内参校正而实现对目DNA 片段拷贝数的确认。
5、高分辨率溶解曲线分析(High resolution melt, HRM)
DNA序列长度、GC 含量及碱基互补性差异影响DNA双链结构的热稳定性。高分辨熔解曲线(high-resolution melt,HRM) 分析是通过实时监测升温过程中与双链DNA特异性结合的荧光染料释放的绿色荧光强度的变化,了解PCR 产物中DNA分子的解链温度情况,分析样品特定基因片段DNA组成变化。实时荧光定量PCR实验运行程序中引入溶解曲线分析环节后,可借助于专用HRM分析模块完成HRM分析。HRM用于突变扫描和基因分型,不受突变碱基位点和种类限制,既可对未知突变进行筛查、扫描,又能对已知突变进行分析,还可用于STR分析。
6、病原体检测(Pathogen detection)
实时荧光定量PCR仪能可靠用于临床医学人体上呼吸道的感染、肺炎、消化道感染、中枢神经系统等疾病,以及畜牧业、农作物病虫害的病原体的检测确认、感染严重程度的量化评估。
7、蛋白热漂移分析(Protein thermal shift)
利用实时定量PCR仪来分析热稳定性,进行配体-蛋白结合的高通量筛选,突变或修饰对蛋白热稳定性的影响
使用蛋白结合染料(如Protein Thermal Shift 染料),实时定量PCR系统上运行实时熔解实验,根据因蛋白熔解导致荧光图像差异,分析配体与蛋白的结合稳定性。可用于以高通量筛选配体与蛋白的结合, 筛选能与蛋白靶点结合的小分子和片段文库候选药物、抗体,鉴定最佳缓冲液条件以改善蛋白的纯化和分离等。
8、食品安全和GMO(genetically modified organism)检测
实时荧光定量PCR技术用于食品的微生物污染监测、肉食类食品食材来源和组成的检验、如转基因动植物基因的检测等。
9、耐药基因检测等
性能特点
Applied Biosystems QuantStutio 7 Pro、QuantStudio 7 Flex实时荧光定量 PCR仪具有简化易用的工作流程、直观应用软件和大型触摸屏界面。可以直接在触摸屏上实施实验参数设置、启动和运行监控和实验数据分析。数据分析程序可将多个数据集整合在一处并以数据可视化形式呈现和分析。
1、样品反应模块可互换
与QuantStutio 1/3/5只能运行单一样品模块不同,QuantStutio 7 Pro、QuantStudio 7 Flex可运行标准96×0.2 mL、快速96×0.1 mL、高通量384孔和TaqMan阵列卡(TAC)检测模块共4种反应模块。
TaqMan 阵列卡使用很少的样品量,在10分钟内只需8个移液步骤即可加载多达384个靶标。
模块更换极其简便:只需按下按钮或使用语音命令,即在96孔(0.1和0.2 mL)、384孔和 TaqMan 阵列卡间轻松切换。
2、多重荧光定量分析
QuantStudio 7 Pro、QuantStudio 7 Flex实时荧光定量PCR仪的OptiFlex光学检测系统,采用宽光谱、高强度白色LED光源,发射波长范围宽,完美胜任最多6重实时荧光定量分析(Multiplex qPCR)应用。
3、实验数据规范化
QuantStudio 7 Pro、QuantStudio 7 Flex实行用户账户管理控制,可建立标准化的实验协议和调用实验模版,提供符合MIQE指南要求的实时数据标记语言(Real-Time Data Mark-Up Language,RDML)导出功能。
与QuantStudio 7 Flex比, QuantStudio 7 Pro还具有以下4-6项新型功能。
4、VeriFlex多温度梯度控制模块
QuantStutio 7 Pro采用 VeriFlex温控模块,能在同一次运行中运行6种不同引物退火温度,便于反应条件的优化(QuantStudio 7 Flex为普通等温样品模块)。
5、智能操作功能
QuantStutio 7 Pro支持智能功能,可以通过面部认证和语音命令(如open Pro instrument, Change block等)免提操作,快速访问个人实验模板和资料。
智能帮助(Smart Help)允许用户直接从触摸屏直接联系技术支持。由经验丰富的技术人员根据用户的偏好(电话或电子邮件)进行响应,提供支持。
6、远程运行及云数据管理
借助于云平台,QuantStutio 7 Pro可以直接从移动设备远程设置实验、控制仪器运行(QuantStudio 6 Flex只能通过电脑联机接入云平台)。
用户不仅可随时随地访问、存储和在线数据共享。还可以基于web浏览器的分析模块工具软件,进行包括相对定量、标准曲线、高分辨率熔体(HRM)、基因分型和存在/缺失等在内的多种qPCR分析。
7、FDA 21 CFR Part 11合规管理功能
仪器软件内含安全、审计、电子签名套件,符合美国联邦法规第21 章第11节法规(21 CFR Part 11) 的特定要求。可自动记录系统上的所有操作,即对用户登入、用户专属的默认程序设定、操作进行监管并记录,用户仅能执行特定功能,所有实验流程都依管理者设定进行。
8、自动化兼容性
其他实验室自动化系统集成,实现全天候自动板加载自动化,提高生产率并减少手动任务。
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