品牌: 61556
公司: 上海境象生物科技有限公司
提供商: Acebiox 服务名称: MassArray SNP 基因分型技术服务 规格: 根据检测基因和位点数量的不同,价格有所不同
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MassARRAYSNP基因分型技术,是由美国Agena Bioscience, Inc.(原Sequenom Bioscience Division)公司开发的基于飞行质谱的分型技术,Acebiox为该公司中国区授权服务商(Agena Certified Service Provider Certificate)。该技术通过PCR扩增跨越SNP位点的DNA序列,然后应用单一延伸引物(extension primer)扩增PCR产物,确保延伸引物只延长一个碱基。延伸产物用飞行质谱(TOF, time of flight)进行分析,根据一个碱基的分子量差别对SNP进行分型,也可做SNP位点等位基因频率计算。MassARRAY SNP基因型分析可以进行多重SNP分型,即一个反应可同时分型多个SNP位点。该技术分析准确,在分析数十上百个SNP时具有价格优势。技术原理
MassARRAY飞行质谱检测系统基本原理为基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱 (MALDI-TOF MS) 技术。将制备好的样品与芯片基质共结晶,将该晶体放入质谱仪的真空管,而后用瞬时纳秒 (10-9s) 强激光激发,由于基质分子经辐射所吸收的能量,导致能量蓄积并迅速产热,从而使基质晶体升华,核酸分子就会解吸附并转变为亚稳态离子,产生的离子多为单电荷离子,这些单电荷离子在加速电场中获得相同的动能,进而在一非电场漂移区内按照其质荷比率加以分离,在真空小管中飞行到达检测器,飞行时间与离子质量成正比。MALDI产生的离子用飞行时间(Time-of-Flight,TOF)检测器来检测,离子质量越小,飞行时间越短。理论上讲,只要飞行管长度足够,TOF 检测器可检测分子的质量数是没有上限的。
图1 飞行时间质谱检测物质分子量的原理
应用领域
MassARRAY SNP基因型分析在生物科学、医学、农业研究和应用等多个领域具有非常好的应用前景,为全世界的科学家们提供优质的解决方案,获得了瞩目的进展。以下是一些代表文献:
肿瘤发病及其相关SNP研究和肿瘤的诊断Sun Tong, et al. Nature Genetics. 2007; 39(5): 605-613糖尿病、心脏病、帕金森、银屑病等各种重要疾病Zhang Xue-Jun, et al. Nature Genetics. 2009; 41(2): 205-210Robert Sladek, et al. Nature. 2007; 445(7130): 881-885Minerva M Carrasquillo, et al. Nature Genetics. 2009; 41(2): 192-198流行病学和病源微生物检测H. Yang, et al. Proc Natl Acad Sci U S A. 2005; 102(21): 7683-7688M Jallow, et al. Nature Genetics. 2009; 41(6): 657-665重要经济和品质性状筛选The Bovine HapMap Consortium, et al. Science. 2009; 324(5926): 528-532
技术特点高性价比:在所有的SNP分型方法中,价格最低。高准确性:采用尖端的飞行质谱的分型技术,能准确检测出单个碱基的差异,分析精准。高灵敏度:检测窗口内,能被检测任何pmol级的物质。高通量:一张芯片可对384个样本进行多重检测,每个体系最多实现36重反应。灵活性:几秒钟就能检测一个反应孔,每天可完成几个乃至上万个反应。无污染:在实验过程中,反应体系始终在同一个试管内进行,无多次转移,减少污染的概率。高效性:最快2周即可提供完整的实验报告。广泛性:超过2000篇SCI文章,包括Nature, Science等顶尖杂志。江苏楚天生物为您提供以下技术服务,也可根据客户需求定制技术服务:
产品名称用途检测位点数iPLEX® ADME PGx Pro Panel药物个性化治疗36个药物代谢关键基因的184个SNP及部分CNVLungCarta™ Panel肺癌检测检测26个肺癌相关致癌基因和抑癌基因的214个突变位点OncoCarta™ Panel 系列V1.0肿瘤检测检测19个致癌基因,238个突变位点OncoFOCUS™ Panel结直肠癌BRAF 19个、EGFR 127个、KRAS 38个、NRAS20个突变MelaCarta Panel黑色素瘤检测检测黑色素瘤相关的20个基因的70多种突变Hemo ID™ Blood Group 系列稀有血型鉴定上百种稀有血型系统多态性检测ALK/RET/ROS1 PanelALK/RET/ROS1检测肿瘤中的ALK/RET/ROS1的已知或未知易位
设备仪器
分型方法设备仪器MassARRAYMassARRAY Genetic Analysis System
图2 MassARRAY Genetic Analysis System平台示意图
样品类型
所有类型样品必须用冰袋寄至公司。冰块应足量,以确保样品寄至公司时,冰块未完全融化。
a)组织样品(需提供≥100mg组织。)b)体外培养细胞(需提供≥10
6个细胞。)c)基因组DNA (需提供≥5μg 基因组DNA)d)全血(需提供≥2mL全血)价格
SNP分型(或基因突变检测)的费用根据需要分型的SNP位点,数目以及样品数量的不同而制定。
提交数据
分型结果示例。以下是MassARRAYSNP基因分型飞行质谱分析图:
图3 MassARRAYSNP基因分型飞行质谱部分分析图
如需要,可提供所使用方法的原始数据。
实验周期
10-30个工作日
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